返祖論
哺乳類的鯨是由陸生祖先演變而來，演化到中間階段的兩棲型態，遇到危險時便會逃上陸地避難，這種習性延續至今，使得今天中樞神經發達的鯨類遇到生命危機或精神緊迫時，還會流露原始的行為，往陸地躲避，導致擱淺。

回聲定位論
鯨類藉回聲定位系統在海中尋找方向及食物，當這個系統出了差錯，譬如疾病、地形混淆或遭遇暴風雨、地震等外力會導致無法辨識方向而擱淺。這個理論常用來解釋鯨類發生的擱淺事件。

寄生蟲疾病論
擱淺的鯨豚常伴有寄生蟲或某些疾病徵兆，嚴重者可能造成身體不適或影響聽覺因而擱淺，然而很多正常的鯨豚身上亦發現許多寄生蟲，其負荷量與致病機制尚待研究。

社群論　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　
群居的鯨群，常有一隻扮演嚮導，一旦此嚮導有異常現象上岸擱淺，其他成員便追隨其後；經常有受傷、未成熟鯨擱淺遇險，合群的鯨可能是基於互相救助的習性，造成了群體擱淺。

攝食論
鯨有近岸攝食習性，會跟縱迴游或生產卵的魚和烏賊，游近岸邊捕食，因戀食忘返，退潮後遂擱淺。

追捕論
當兇猛的鯨類(如虎鯨)追趕較小型鯨類(如條紋海豚或領航鯨)時，虎鯨的聲音可能使條紋海豚在驚慌之下逃向岸邊，雖暫時逃離虎鯨，卻因不習慣淺水域而擱淺。

汙染論
工業產生的廢物引起鯨類體內毒素的累積，如在雄性脂肪中的多氯聯苯今量造成精子濃度的減少，降低生育能力；或食用有毒物質而致死亡。

自然毒素　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　
海中的有毒藻類大發生時，如紅潮，鯨豚遭遇後可能中毒而擱淺。

氣候論
海嘯、地震、颱風及寒流等，惡劣的氣候因子可能使某些鯨豚個體不堪支撐而擱淺上岸，或游進不熟悉的淺灣環境。

地形論
在地形複雜處，可能造成鯨豚擱淺，大洋性的鯨豚較常在沿岸發生擱淺。有時，因淺水地區會使鯨豚誤判回聲的訊息，尤其是在沙岸斜坡，或是在暴風期間，水中混有大量的氣泡及沙子，故特殊地形配合氣候亦可能造成擱淺。

地磁論
英國林諾斯卡(Klinowska)博士認為鯨類洄游時是沿著磁場地形而移動，在歐洲許多擱淺發生在磁力場走向與海岸線成垂直，另外，在美國克斯奇維克(Kirschvink)博士亦有相似之發現，這個說法目前是相當熱門的。

人類傷害 　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　
鯨在海中有些經歷漁網劫難或標槍刺射後，雖僥倖逃脫，然或因驚慌，或因身體受傷無法正常游行而擱淺。